Av Julie Granka, Ph.D.
När någon gör ett AncestryDNA-test jämför vi deras DNA med DNA från de miljontals andra testtagarna i AncestryDNA-databasen. Vi letar efter ”DNA-matchningar” (på engelska) – personer som delar identiskt DNA med varandra och som kan vara släkt genom en ny gemensam förfader.
Men identiskt DNA kan delas mellan personer av andra skäl än en ny gemensam förfader. Identiskt DNA kan också delas när båda personerna är av samma härkomst.
Ancestry har därför Ancestry utvecklat ett speciellt verktyg för att behålla det gemensamma identiska DNA som kommer från en gemensam förfader. Detta verktyg kallas Timber, och det hjälper Ancestry att ge dig en mer exakt uppskattning av relationen (på engelska) mellan dig och dina matchningar.
Delat DNA betyder inte alltid en ny gemensam förfader
Huvudtanken bakom att identifiera en DNA-matchning är att leta efter DNA-bitar som två personer båda har eftersom de var och en ärvt den från en nyligen gemensam förfader. I vårt DNA-matchningsdokument beskriver vi de åtgärder vi vidtar för att omvandla dina genetiska data och de andra personerna i AncestryDNA-databasen till dessa föreslagna DNA-matchningar.
Ett av dessa steg är att identifiera DNA-bitar eller DNA-segment som sannolikt är identiska mellan par av personer. Men om två personer har identiskt DNA betyder det inte nödvändigtvis att de ärvt det från en nyligen delad förfader. DNA-bitar kan vara identiska mellan två personer eftersom de har samma härkomst. Som en del av de genetiska processerna som sker över tid kan en population av människor dela ett specifikt segment eller segment av identiskt DNA mellan alla dess medlemmar. Detta händer på grund av endogami inom en population och isolering (genetiskt) från andra populationer.
Timber ger dig mer exakta relationsuppskattningar
Så för att hitta DNA-matchningar som beror på de senaste förfäderna behöver vi ett filtreringssteg. På AncestryDNA använder vi en algoritm som utvecklats av vetenskapsteamet kallat Timber. Den grundläggande idén är att om två personer verkar ha identiskt DNA på en viss plats i genomet, men de verkar också ha identiskt DNA med tusentals andra personer på samma plats, då delades DNA mellan de två personerna förmodligen från en gemensam region snarare än en nyligen gemensam förfader. Med andra ord är det delade DNA:t förmodligen inte från en gemensam förfader inom de senaste 6 eller 10 generationerna och är förmodligen inte meningsfullt för släktforskning (på engelska). I sådana fall kan Timber filtrera bort identiska DNA-bitar helt och hållet, vilket ger dessa personer en bättre uppskattning av hur de är släkt.
Timber filtrerar oftast bort kortare segment av delat DNA
DNA som du delar med dina matchningar distribueras över DNA-segment. Om du tänker på ditt och matchningens DNA som två böcker är delade DNA-segment identiska meningar eller stycken i båda böckerna. Längden på det längsta segmentet som du och en DNA-matchning delar kan hjälpa dig att bestämma släktskapet. Vanligtvis innebär det när man delar färre, längre segment att det finns ett närmare släktskap. Kortare segment av delat DNA kan indikera en avlägsen relation eller identiskt DNA på grund av en delad region.
När vi tittade på de delade DNA-segmenten som togs bort av Timber för en undersökning av 300 000 Ancestry-kunder såg vi att de flesta av de borttagna segmenten är kortare (<10 cM). Se tabellen nedan.
Vi fann emellertid att i vissa fall avlägsnades även längre identiska segment (>15 cM) av Timber. Vad detta visar är att det finns mycket mer än bara storleken på de identiska DNA-segmenten att tänka på när man försöker identifiera delat DNA från en ny gemensam förfader.
Timber gör släktforskning enklare
Genom att använda Timber kan vi hitta delat DNA som är mer sannolikt att bero på nya gemensamma förfäder. Timber är exceptionellt kraftfullt när det gäller att ta bort DNA-matchningar som beror på en gemensam region, snarare än en ny gemensam förfader. Detta begränsar listan med DNA-matchningar till en mer hanterbar och informativ uppsättning.
Timber är ett personanpassat filter som är unikt möjligt med AncestryDNA:s enorma databas. Därför kan AncestryDNA-testtagare få DNA-matchningar som är mer tillförlitliga för släktforskning.